La diversité des écosystèmes microbiens, présente dans une grande variété d’environnements allant des sources hydrothermales aux sols, océans...etc. , revêt une importance écologique et un intérêt biotechnologique majeur. Ces micro-organismes, riches en diversité taxonomique et fonctionnelle, jouent un rôle clé dans les cycles biogéochimiques, la dégradation des matières organiques et le maintien des équilibres écologiques. En biotechnologie, ils constituent une source précieuse de biomolécules telles que les enzymes, antibiotiques, pigments et métabolites, utiles dans les secteurs de la santé, de l’agroalimentaire et de l’industrie. Leur capacité à dégrader des composés complexes en fait des alliés pour la bioremédiation, tandis que les micro-organismes extrêmophiles ouvrent la voie à des applications innovantes et robustes. Ainsi, la compréhension et l’exploitation de cette diversité microbienne permettent à la fois de préserver les écosystèmes et d’innover dans de nombreux domaines industriels. L’objectif  de ce cours est de développer des compétences solides en microbiologie tout en intégrant les aspects fondamentaux et appliqués.