Ce cours porte sur les écosystèmes aquatiques. Les espèces (faune et flore) ainsi que les paramètres du milieu (dont lequel ces espèces prospèrent) seront traités. Ce cours est scindé en trois chapitres complémentaires. Le premier chapitre traite les caractères généraux des milieux aquatiques. Le deuxième  se focalise sur les milieux lentiques. Enfin, le troisième chapitre aborde les milieux lotiques.